次氯酸鈉已經用牙膠尖的消毒，它溶于水后形成次氯酸和氫氧化鈉，次氯酸鈉溶液接觸組織蛋白后，短時間內形成氮、甲醛和乙醛等物質，導致肽鏈破壞及蛋白質溶解，從而改變細胞內的滲透壓，導致細胞死亡。正是由于這種殺菌機制，殘余在牙膠尖上的次氯酸鈉就有可能造成根尖周組織的破壞。
強酸性電解質水有與次氯酸鈉一致的殺菌的作用。但是，強酸性電解質水有對組織無毒無刺激、使用后會還原成水沒有殘余、沒有副產物等優點，同時其制造方法簡單、成本低。因此，可以考慮將強酸性電解質作為次氯酸鈉的替代品對牙膠尖進行消毒。
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