次氯酸鈉溶液不穩定，保存不當容易分解。其穩定性受溫度、光照、pH值和重金屬離子的影響。次氯酸鈉濃度越高、溫度越高，濃度衰減越快。當存在鐵、銅、鎳和鈷時。可加速次氯酸鈉分解。鐵的含量及時低于0.5mg/L也將使溶液濃度在幾天之內降低15%，在溶液中銅的濃度不應高于1mg/L。
低濃度的次氯酸鈉（濃度10%），pH值=11，鐵、銅鎳的含量小于0.5mg/L，在21℃左右避光貯存。
在使用次氯酸鈉溶液消毒時，必須注意保存條件，經常分析化驗其有效氯含量，以便掌握有效氯的衰減情況，確定每次的最佳送貨量和送貨周期，減少氯的損失。
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